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pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)

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 UC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)所克隆的ORF1ab(168bp)含有中国疾控中心所公布的SARS-CoV-2冠状病毒基因组中开放读码框ORF1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)荧光检测RT-PCR特异性引物(1ab-F: 5'-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3';1ab-R: 5'-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3',该对引物扩增产生119bp片段)扩增所包含区域,该克隆适用于SARS-CoV-2 的特异性检测。

SARS-CoV-2 ORF1大约占整个基因组长度的三分之二,位于病毒基因组5'端,编码病毒复制酶,包括ORF1a和ORF1b。ORF1a和ORF1b分别编码两个多聚蛋白(poly-protein)即pp1a和pp1ab,多聚蛋白产生后,被病毒编码的类胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin-like protease,3CLpro )或1-2个类木瓜蛋白酶(papain-like protease,PLP)水解为具有独立生物学功能的十六个非结构蛋白(NSP1-NSP16),其中ORF1a 编码 NSP1-NSP11,而ORF1b编码NSP12-16。

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)质粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
M13/pUC Forward Primer 378-395
ORF1ab 405-572
Multiple cloning site 573-594
M13/pUC Reverse Primer 608-625
Lac operator 633-649
Lac Promoter 657-687
ColE1 origin of replication(Ori) 1011-1599
Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region 1770-2630

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)质粒(2830bp)的图谱如下:

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)的多克隆位点的详细图谱见

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab (168bp))包括:

AflII

AccI AfeI AgeI AleI ApaI AscI
AsiSI AvrII BaeI BbsI BbvCI BfuAI BglII
BlpI BmgBI BmtI Bpu10I BsaAI BsaBI BseRI
BsgI BsiWI BsmFI BsmI BspDI BspEI BspMI
BsrGI BssHII BstBI BstEII BstXI BstZ17I Bsu36I
BtgI BtgZI ClaI CspCI DraIII EagI EcoNI
EcoRV FseI HincII HpaI MfeI MluI MscI
NaeI NcoI NgoMIV NheI NotI NruI NsiI
PacI PaeR7I PflFI PflMI PmeI PmlI PpuMI
PshAI PsiI PspOMI PspXI PstI RsrII SacII
SalI SbfI SexAI SfiI SgrAI SnaBI SpeI
SphI SrfI StuI StyI SwaI Tth111I XbaI
XcmI XhoI          

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp))包括:

AatII G,ACGT`C 2761 EcoO109I RG`GNC,CY 2819
Acc65I G`GTAC,C 282 EcoRI G`AATT,C 594
AflIII A`CRYG,T 950 HindIII A`AGCT,T 399
AhdI GACNN,NN`NGTC 1842 KasI G`GCGC,C 235
AlwNI CAG,NNN`CTG 1363 KpnI G,GTAC`C 586
ApoI R`AATT,Y 594 NarI GG`CG,CC 236
AvaI C`YCGR,G 578 NdeI CA`TA,TG 184
BamHI G`GATC,C 573 NmeAIII GCCGAG(N)19,NN` 1900
BanII G,RGCYC 588 PciI A`CATG,T 950
BcgI ,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN` 2346 PluTI G,GCGC`C 235
BclI T`GATC,A 501 SacI G,AGCT`C 592
BpmI CTGGAG(N)14,NN` 1911 SapI GCTCTTCN`NNN, 834
BsaI GGTCTCN`NNNN, 1904 ScaI AGT|ACT 2323
BsaXI ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` 792 SfoI GGC|GCC 237
BseYI C`CCAG,C 1254 SmaI CCC|GGG 580
BsoBI C`YCGR,G 578 SspI AAT|ATT 2647
BspQI GCTCTTCN`NNN, 834 TspMI C`CCGG,G 578
BsrFI R`CCGG,Y 1923 XmaI C`CCGG,G 578
BstAPI GCAN,NNN`NTGC 182 XmnI GAANN|NNTTC 2442
Eco53kI GAG|CTC 590 ZraI GAC|GTC 2763

pUC18-SARS-CoV2-ORF1ab(168bp)质粒中推荐使用的测序引物序列如下:

M13 fwd(378-395): 5'- TGTAAAACGACGG CCAGT -3'

M13 rev (608-625): 5'- CAGGAAACAGCTATGACC -3'

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)的全序列信息:D2953 pUC18-SARS-CoV2-ORF1ab(168bp)序列.txt。

包装清单:

产品编号 产品名称 包装
D2953-1μg pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) 1μg
D2953-100μg pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) 100μg
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本质粒未经书面许可不得用于任何商业用途,也不得移交给订货人所在实验室外的任何个人或单位。

本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

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