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pAdEasy-1/BJ5183 甘油菌(腺病毒重组配套菌)

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 pShuttle-CMV-C-DsRed (腺病毒质粒, 红色荧光)是自行研发的用于构建表达C端DsRed(红色荧光蛋白)融合蛋白的重组腺病毒包装用的穿梭质粒。本穿梭质粒构建后,需要和预转染了pAdEasy-1质粒的BJ5183菌株(D8107)以及重组腺病毒包装细胞配合使用才能完成重组腺病毒的包装。

pShuttle-CMV-C-DsRed质粒可以用于在包装成腺病毒后表达C端含DsRed (Discosoma sp. red fluorescent protein,香菇珊瑚红色荧光蛋白)标签的融合蛋白。该质粒含有CMV启动子,可以高效启动目的蛋白在细胞中的表达。在多克隆位点的后面有一个DsRed的完整编码序列,因此在多克隆位点根据阅读框插入目的基因就可以表达C端含有DsRed标签的融合蛋白。利用DsRed的荧光特性可以比较容易地观察融合蛋白的表达水平和细胞内定位,也可以利用DsRed抗体来检测或免疫沉淀融合蛋白。DsRed与GFP没有序列同源性,不能使用GFP抗体检测DsRed。

本质粒为卡那霉素抗性。

重组腺病毒(Recombinant adenoviruses)是一种常见的用于在培养细胞或动物体内表达外源基因的重要工具。重组腺病毒具有感染宿主细胞范围广、感染不依赖细胞分裂、高滴度及目的基因表达水平高等特性。最常用的腺病毒载体是人类血清5型腺病毒。改造后的人类血清5型腺病毒,删除了在病毒装配过程中起关键作用的E1基因和非必须的能表达逃避宿主免疫的E3基因,E1和E3基因的删除使得重组腺病毒不能自我复制,同时给外源基因的插入提供了空间,最长可插入7.5kb的外源基因。从而提高了重组腺病毒的的安全性和可操作性。再利用携带E1基因的AD-293、293A、HEK293等细胞作为包装细胞就可以完成重组腺病毒的包装。

pShuttle系列的穿梭质粒携带外源目的基因,经过Pme I线性化,随后与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1(D8106)共转化到大肠杆菌BJ5183中,或者转化到已经预转化了pAdEasy-1质粒的BJ5183菌株(D8107)中同源重组。BJ5183菌株表达recET基因,具有很高的基因同源重组(homologous recombination)活性,使带有目的基因的穿梭质粒与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1通过末端反向重复序列同源重组,实现外源基因与腺病毒基因组的整合。将重组的携带外源基因的腺病毒质粒用Pac I线性化后转染到AD-293、293A、HEK293等重组腺病毒包装细胞中进行包装。从而制备获得高滴度、自我复制缺陷并且带有目的基因的重组腺病毒。

目的基因引入时不能含有Pme I及Pac I这两个酶切位点,如果含有该两个酶切位点的目的基因,需要对该位点进行突变方可进行基因操作。

pShuttle-CMV-C-DsRed主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
left inverted terminal repeat 1–103
encapsidation signal (ES) 183–331
CMV promoter 341–933
multiple cloning site 940–988
DsRed 993-1670
SV40 polyA 1690–1901
Ad5 right arm homology 1906–4160
Ad5 left arm homology 4208–5091
right inverted terminal repeat 4192–5194
pBR322 origin 5402–6069
kanamycin resistance ORF 6878–7669

pShuttle-CMV-C-DsRed 质粒(8155bp)的图谱如下:

pShuttle-CMV-C-DsRed质粒的详细图谱见说明书:https://www.beyotime.com/Manual/D8115 pShuttle-CMV-C-DsRed.pdf。

pShuttle-CMV-C-DsRed 中没有的酶切位点(Restriction enzymes that do not cut pShuttle-CMV-C-DsRed)包括:

Acc65I Afl II Age I Asc I Asp718
Blp I BsiC I BsiW I BstB I Bsu36 I
Cla I Eco72 I EcoN I Esp I Fse I
Kpn I Nru I Pml I Pvu I Sfi I

pShuttle-CMV-C-DsRed 中的单酶切位点(Restriction enzymes that cut pShuttle-CMV-C-DsRed once)包括:

SnaB I TAC|GTA 679 Sca I AGT|ACT 1683
Nhe I G`CTAG,C 940 Hpa I GTT|AAC 1800
Not I GC`GGCC,GC 945 BstX I CCAN,NNNN`NTGG 3017
BamH I G`GATC,C 952 Bst1107 I GTA|TAC 4173
Hind III A`AGCT,T 958 Xca I GTA|TAC 4173
EcoR V GAT|ATC 966 Pme I CTTT|AAAC 4194
Sal I G`TCGA,C 970 EcoR I G`AATT,C 4199
Mlu I A`CGCG,T 976 Avr II C`CTAG,G 4741
PaeR7 I C`TCGA,G 988 BspH I T`CATG,A 6137
Xho I C`TCGA,G 988 Psp1406 I AA`CG,TT 6536
Stu I AGG|CCT 1204 Rsr II CG`GWC,CG 7542
Xba I T`CTAG,A 1672 Xmn I GAANN |NNTTC 8143
Spe I A`CTAG,T 1678      

pShuttle-CMV-C-DsRed 质粒中推荐使用的测序引物序列如下:

forward primer (888-907): 5´GGTCTATATAAGCAGAGCTG3´

Reverse primer (1692-1714): 5´GTGGTATGGCTGATTATGATCAG 3´

pShuttle-CMV-C-DsRed的全序列信息:pShuttle-CMV-C-DsRed2.txt

 
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