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人类嗜T淋巴细胞病毒1型探针法荧光定量RT-PCR试剂盒

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人类嗜T淋巴细胞病毒1型(HumanT-lymphotropicVirus1HTLV1)是一种感染后可导致血癌或其他转移癌的RNA病毒,在体内主要感染CD4+T淋巴细胞可引起成人T淋巴细胞白血病/淋巴瘤、HTLV相关脊髓病(HTLV-Iassociatedmyelopathy,HAM/热带痉挛性下肢瘫,tropicalspasticparaparesisTSP)及色素层炎(uveitis),主要通过输血、针头、性行为、母子传染。HTLV-I病毒是艾滋病毒(HIV-I)的远亲,但HTLV-I和艾滋病的发生没有任何关连。目前各捐血中心以酵素免疫法全面筛检HTLV-I病毒。本产品就是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的人类嗜T淋巴细胞病毒1型探针法荧光定量RT-PCR试剂盒,它具有下列特点:

1.即开即用,用户只需要提供样品RNA模板。

2.引物和探针经过优化,分析灵敏性高。

3.提供阳性对照,便于区分假阴性样品。

4.特异性高,引物是根据HTLV病毒1型高度保守区设计,不会跟其他病毒的RNA发生交叉反应。

5.可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5个数量级。

6.本产品足够50次 20μL体系的探针法荧光定量RT-PCR反应。

成分

编号

五孔盒包装

探针法qRT-PCR缓冲液

190504a

500μL白盖

探针法qRT-PCR酶混合液

190504b

100μL红盖

荧光PCR专用模板稀释液

180701

1mL(绿盖

HTLV病毒1型探针法qRT-PCR

引物-探针混合液

15-87810yp

150μL棕色管)

HTLV病毒1型探针法qRT-PCR

阳性对照(1×10E7拷贝/μL)

87810pc

50μL黄盖

使用手册

15-87810sc

1份

本产品只能用于科研。

运输及保存低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

自备试剂样品RNA,超纯水。

使用方法

一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。

1.  标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。

2.用带芯枪头分别加入45μL荧光RT-PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同。

3.在6号管中加入5μL1×10E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

4.换枪头,在5号管中加入5μL1×10E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E5拷贝/μL的 标准曲线样品。放冰上待用。

5.换枪头,在4号管中加入5μL1×10E5拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

6.重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。二、样品RNA的制备

7.如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的是PC(样品制备阳性对照)和NC(样品制备阴性对照)。可以取阳性对照的1000倍稀释液10μL再加上一定量的水,使总体积与待提取样品的规定体积一致,以此作为PC。另外用水作为NC。

8.用自选方法纯化样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒RNA提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的柱式病毒RNAout或免提取核酸释放剂。

三、Probe qRT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)

9.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记 N+9个 RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个 RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),1个用于 RT-PCR阳性对照(用第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。

10.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):

成分/每管

样品管

N+2

RT-PCR

阴性对照

标准曲线样品管

1-6管)

探针法qRT-PCR缓冲液

10μL

10μL

10μL

探针法qRT-PCR酶混合液

2μL

2μL

2μL

HTLV病毒1型探针法qRT-

PCR引物-探针混合液

3μL

3μL

3μL

N+2个待测RNA样本

5μL

不加

不加

自备超纯水

不加

5μL

不加

6步所得标准曲线样品稀释液

1-6号)

 

不加

 

不加

5μL1号样到

1号管,2号样

2号管…)

11.盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:

过程

温度

时间

逆转录

50℃

20min

预变性

95℃

10min

RT-PCR反应

45个循环)

95℃

15sec

 

60℃

1min采集FAM通道的荧光信号

五、数据处理
12.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。
13.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于33。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于32。对待测样品,如果其Ct大于或等于33则为阴性,如果小于或等于32则为阳性。如果在32-33之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于33则为阴性,如果小于33,则为阳性。

 

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