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荧光及可视化 RT-LAMP 扩增试剂盒

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 荧光及可视化 RT-LAMP 扩增试剂盒是根据本公司的双染料 RT-LAMP 专利技术开发的荧光和可见光双模式检测试剂盒,它既可以用于荧光 RT-LAMP 扩增及检测,也可以用于可视化 RT-LAMP扩增及检测,适用于各种针对核酸的快速定性检测。本产品具有下列特点:

1. 含可见光和荧光染料,既可以用金属浴和水浴扩增用可见光肉眼判断结果,也可用荧光 PCR 仪进行实时荧光检测。

2. 内含的 dUTP-UNG 可防交叉污染。

3. 特异性比 RT-PCR 高,因为 RT-LAMP 扩增使用 4-6 条引物而不是两条。

4. 灵敏性可达 10 拷贝/反应以下(随引物而不同,故假阴性率更低。

只可用于科研,只可进行定性检测,不能用于定量检测。

 

编号

塑料盒包装

MMLV 逆转录酶(含 RI200U/μL

60905a

50 μL黄盖

4×RT Buffer(dNTP)

60905b

250 μL白盖)

5×荧光及可视化LAMP MagicMix

200603a

200 μL绿盖

Bst DNA 聚合酶 2.0(8U/uL)

200403

50 uL (红盖)

RT-LAMP 阳性对照模板-引物混合物

130923a

20 μL(黄盖

超纯水

100935

1mL(亮黄盖)

使用手册

200603sc

1 份

 

低温运输,-20℃保存,保存期限为一年

 

RT-LAMP 模板及 RT-LAMP 引物、PCR 级石蜡油仅对使用金属浴或水浴者)。

准备工作:如果使用水浴锅或金属浴,需要在实验启动前打开并调到 60-65℃。如果用金属浴,还必须在孔中加水以填充金属孔和反应管间的空隙。金属浴和水浴温控远远不如PCR 仪器,所以使用前需要用阳性对照和阴性对照(水)做预实验确认可用。一、样品 RNA 的制备

1. 用自选方法纯化样品的 RNA,本试剂盒跟市场上大多数 RNA 提取试剂盒兼容。

2. 如果有 N 个样品,则至少需要做 N+2 个样品制备,包括一个制备阳性对照制备时加入自备的跟要检测的靶分子相同的阳性对照模板,一起经历提取过程和一个制备阴性对照(用水替代样品)。最后 N+2 个样品一起进行 RNA 提取操作,得 N+2  RNA 样品。

二、合成 1st-strand cDNA

 

按下表配制 RT 反应体系:

 

成分

加入量

 

自备 RNA 模板RNA

 poly(A) mRNA

或专一的 RNA

注意:RNA 样品不能有基因组 DNA 污染。

 

100-500 ng

10-500 ng

0.01pg-500ng

自备引物 F3

1 μL

4×RT Buffer(dNTP)

5 μL

自备 RNase-free 

补水到 19 μL

 

4. 70℃保温 5 分钟后立即冰浴。

5. 37℃保温 5 分钟。对富含二级结构的高 GC RNA 模板,可改成 45℃保温 5 分钟。

6. 加入 1μL (=200 U) MMLV 逆转录酶( RI,终体积为 20μL

7. 42℃保温 60 分钟。

8. 70℃保温 10 分钟以终止反应,放置在冰上待用。合成的 cDNA 可以直接作为

LAMP 模板使用,不需要纯化。

三、 荧光及可视化 LAMP 扩增及检测(20μL 体系)

9. 反应设置:如果有 N+2  cDNA 样品,则最好设置 N+4 LAMP 扩增,增加 LAMP

阴性对照和 LAMP 阳性对照各 1 个。在 N+4  0.2mL PCR 管中加入下列成分:

10. 混匀后进行扩增。由于本产品含双染料,可以根据实验室条件选择下列三种方式进行扩增和检测。

11. 如果使用PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,肉眼检测,则必须先在每个反应管中 30 μL 自备的石蜡油,否则保温期间反应体系的水分会蒸发,影响反应效率(如果使用 PCR 仪器并开启热盖,则可以不加石蜡油60-65℃保温 90 分钟,肉眼观察管内液体颜色。

 

12。如果使用荧光定量 PCR 仪:设为 60-65℃保温 1 分钟/循环, 90 个循环,每分

钟在 FAM 通道采集一次荧光信号。

 

13. 如果使用PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,再使用 qPCR 仪进行终点法荧光读数: 则在扩增前和扩增后,分别在 qPCR 仪器上测荧光读数温度设为 60-65℃,1 次循环,每次循环 1 分钟,在 FAM 通道采集一次荧光信号。注意:测荧光读数必须在 65℃进行。扩增反应按 60-65℃,90 分钟进行。

四、 结果分析及解读

14. 如果是用普通PCR 仪器、水浴或金属浴进行的扩增,反应结束后只能肉眼判断结果。将反应管放置在白色背景如白纸前观察。扩增阳性对照管内反应液将呈现蓝色,无模板和无引物的阴性对照将呈浅蓝色。如果扩增阳性对照管内反应液不呈现蓝色,或无模板和无引物的阴性对照任何一个呈现蓝色,则说明试剂有问题,实验无效。请跟厂家联系。

15. 如果实验有效,则分析 N+2 个样品管的结果。如果样品管反应液的颜色接近扩增阳性对照管则说明有扩增,如果接近无模板和无引物的阴性对照,则说明无扩增。反应结果示例见左图9 为阴性10 为阳性)。

16. 如果是用荧光PCR 仪进行扩增,则可分析扩增曲线和 Ct。试剂盒提供的阳性对照 Ct 将小于 60,如果大于 60,说明试剂可能失效,需跟厂家联系。无模板阴性对照和无引物阴性对照的 Ct 将大于 90。如果任何小于 90,则说明试剂或环境被污染,需重复实验或跟厂家联系。如果阳性对照和阴性对照 Ct 都在正常范围,则分析样品的 CtCt 小于 60 的判断为阳性,大于 90 判为阴性,在 60-90 之间则需要重复检测。

17. 如果使用 PCR 仪、金属浴或水浴进行扩增,肉眼检测,再使用荧光定量 PCR 进行终点法荧光读数来判断阴阳性,则先比较阳性对照和阴性对照。阳性对照样品扩增后信号增幅应该超过 100%,阴性对照扩增后信号增幅应该低于 50%,否则实验无效,请与厂家联系。如果两个对照均有效,则比较样品扩增前后荧光读数的差值。如果扩增后荧光信号增幅低于 50%,则判断为阴性。如果荧光信号增幅高 100%,则判断为阳性。荧光信号增幅在 50-100%之间的,则需要重测。

18. 当实时荧光检测和可视化检测同时用于判读结果时,如果彼此不一致,以实时荧光LAMP 的数据为准。一般可视化结果滞后实时荧光检测结果 20-30 分钟,也就是说,在 qPCR 仪上第 30 分钟时呈现阳性的样品,其反应液的颜色变化一般在第

 

50-60 分钟时才能观察到。

 

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